Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-Q1O19441 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms