Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Lhx6-202ENSMUST00000112961 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC153364.1-201ENSMUST00000220081 1510 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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