Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms