Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm5225J3QPL3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms