Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Gm5294J3QP53 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Gm5294J3QP53 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm5294J3QP53 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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