Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm20371-201ENSMUST00000203354 1756 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Otog-202ENSMUST00000209802 3558 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4930525C09Rik-201ENSMUST00000217919 677 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tmem181b-ps-202ENSMUST00000180035 2426 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC154300.1-201ENSMUST00000219735 2627 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpc-205ENSMUST00000227242 2617 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp946-202ENSMUST00000120222 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr718-ps1-201ENSMUST00000164536 3962 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dbndd2-203ENSMUST00000109349 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gigyf2-205ENSMUST00000172794 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms