Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21977F6U3N7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms