Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc8E9PWG2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc8E9PWG2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms