Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm5478D3Z6R0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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