Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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