Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms