Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms