Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp42B2RQC2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp42B2RQC2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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