Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NhsB1AV60 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms