Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Speer3W4VSP1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer3W4VSP1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer3W4VSP1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms