Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5114W4VSN8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5114W4VSN8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms