Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hdac5Q9Z2V6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hdac5Q9Z2V6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hdac5Q9Z2V6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms