Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdac6Q9Z2V5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdac6Q9Z2V5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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