Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccne2Q9Z238 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne2Q9Z238 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms