Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfxankQ9Z205 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfxankQ9Z205 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms