Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uso1Q9Z1Z0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Uso1Q9Z1Z0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uso1Q9Z1Z0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms