Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek4Q9Z1J2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek4Q9Z1J2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms