Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sumo3Q9Z172 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms