Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp5Q9Z131 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp5Q9Z131 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3bp5Q9Z131 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5Q9Z131 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5Q9Z131 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp5Q9Z131 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms