Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PoleQ9WVF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PoleQ9WVF7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms