Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clcn5Q9WVD4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clcn5Q9WVD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clcn5Q9WVD4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms