Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapaQ9WV55 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VapaQ9WV55 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VapaQ9WV55 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VapaQ9WV55 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VapaQ9WV55 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VapaQ9WV55 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VapaQ9WV55 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VapaQ9WV55 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms