Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnip1Q9WUU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnip1Q9WUU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnip1Q9WUU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms