Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn3Q9WUK7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Opn3Q9WUK7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms