Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcsQ9WU84 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcsQ9WU84 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcsQ9WU84 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms