Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfsf13bQ9WU72 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms