Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cul1Q9WTX6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cul1Q9WTX6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cul1Q9WTX6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms