Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sorbs3Q9R1Z8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs3Q9R1Z8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms