Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc26a4Q9R155 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc26a4Q9R155 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms