Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zeb2Q9R0G7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zeb2Q9R0G7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zeb2Q9R0G7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zeb2Q9R0G7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms