Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vav3Q9R0C8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vav3Q9R0C8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vav3Q9R0C8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vav3Q9R0C8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vav3Q9R0C8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vav3Q9R0C8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vav3Q9R0C8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms