Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lamc3Q9R0B6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lamc3Q9R0B6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lamc3Q9R0B6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms