Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkab1Q9R078 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prkab1Q9R078 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkab1Q9R078 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms