Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcamQ9R069 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcamQ9R069 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcamQ9R069 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BcamQ9R069 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcamQ9R069 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BcamQ9R069 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms