Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp11cQ9QZW0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp11cQ9QZW0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp11cQ9QZW0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms