Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms