Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clcf1Q9QZM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clcf1Q9QZM3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms