Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnnt3Q9QZ47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnnt3Q9QZ47 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tnnt3Q9QZ47 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnnt3Q9QZ47 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms