Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Exo1Q9QZ11 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Exo1Q9QZ11 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Exo1Q9QZ11 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Exo1Q9QZ11 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Exo1Q9QZ11 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Exo1Q9QZ11 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Exo1Q9QZ11 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Exo1Q9QZ11 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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