Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd4Q9QY39 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd4Q9QY39 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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