Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx8Q9QXV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cbx8Q9QXV1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cbx8Q9QXV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms