Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1nQ9QXV0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcsk1nQ9QXV0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk1nQ9QXV0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms