Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnip3Q9QXT8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip3Q9QXT8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms