Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trp53inp1Q9QXE4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms