Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcea2Q9QVN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms